在商標轉讓協議的簽署過程中，簽字和蓋章都可以作為有效的確認方式。簽字是最常見的確認方式，但蓋章也是一種法律通用的確認方式。因此，在商標轉讓簽字還是蓋章哪個有效的問題上，兩者都是有效的確認方式。

一、商標轉讓簽字還是蓋章有效

1、簽字確認方式

簽字是最常見的確認方式之一，指雙方在商標轉讓協議上簽下自己的名字以示同意和認可。簽字形式可以是手寫、電子或數字簽名等方式，均屬于法律通用的確認方式之一。簽字需要保證本人確認和真實性，并且不得涂抹、篡改等行為。

2、蓋章確認方式

蓋章是商業活動中經常使用的確認方式之一。商標轉讓協議的蓋章形式包括公章、合同專用章、財務專用章等多種方式，根據不同情況具體選用。蓋章時需確保章面清晰、印泥鮮艷，以確保蓋章的真實性和合法性。

二、商標轉讓協議中確認方式的約定

商標轉讓協議中應當約定確認方式，以確保確認結果的合法性和真實性。在簽署協議前，需仔細閱讀協議條款，確認確認方式的約定內容。

三、商標轉讓的注意事項

在商標轉讓協議簽署過程中，需注意以下問題。首先，在簽字或蓋章前，應當認真閱讀協議條款并核實相關信息，確保協議的真實性和合法性。其次，選用簽字或蓋章方式時，需遵守相關法律規定，確保確認結果的合法性和有效性。最后，在商標轉讓協議簽署完成后，需妥善保管協議文件，以備后續需要。

綜上所述，商標轉讓簽字還是蓋章都是有效的確認方式，具體選用哪種方式應根據自身情況和商業慣例進行選擇。在商標轉讓協議簽署過程中，需確保確認方式的約定內容、遵守相關法律規定，以確保確認結果的合法性和有效性。